SYNCED está ambientada en un futuro próximo de nuestro mundo, donde la nanotecnología se ha convertido en la columna vertebral de la civilización. Tras una catástrofe conocida como el Colapso, las nanomáquinas se han vuelto contra sus creadores. Consumen a los humanos para reproducirse y transformarse en las mortales nanos. En este apocalipsis, los jugadores asumen el papel de un Runner, un valiente soldado de fortuna que recorre el Meridiano en busca de la valiosa sustancia nanoenergética Nerva.

SYNCED añade un giro innovador al género de los shooters cooperativos, en el que los Runners no sólo se unen en equipos de tres, sino que también pueden sincronizarse con los Prime Nanos derrotados y convertirlos en Companion Nanos. Se trata de un recurso adicional que puede utilizarse estratégicamente en las trepidantes batallas PvE y PvP del juego.

SYNCED también añade elementos de los shooters de saqueo clásicos, ya que los corredores pueden adquirir recursos en las batallas PvE y PvP para mejorar su personaje. Al mismo tiempo, desbloquean armas más potentes y mods que se adaptan mejor a su estilo de juego.